W momencie wprowadzenia obligatoryjnego JPK_CIT w środowisku podatkowym występowały kontrowersje dotyczące obowiązku przesyłania danych zagranicznych oddziałów samobilansujących, które nie prowadzą w Polsce ksiąg rachunkowych. Wątpliwości powstają zarówno od strony technicznej, ale również prawnej i ekonomicznej, ponieważ zagraniczny oddział prowadzi własne księgi rachunkowe zgodnie z przepisami tego kraju, gdzie wykonuje on działalność.
W przypadku obowiązku przesyłania przez polską spółkę pliku JPK_CIT również w odniesieniu do jej zagranicznego oddziału mogłaby wystąpić konieczność prowadzenia podwójnych ksiąg rachunkowych – przez oddział, który posiada własny system finansowo- księgowy w kraju prowadzenia przez niego działalności oraz przez spółkę w Polsce.
Zgodnie z wprowadzonym przepisem w ustawie o CIT (art. 9 ust. 1c), podatnicy prowadzący księgi rachunkowe są obowiązani prowadzić te księgi przy użyciu programów komputerowych oraz przesyłać właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego te księgi po zakończeniu roku podatkowego, w terminie do dnia upływu terminu złożenia zeznania. Przy czym, nowa struktura pliku JPK_KR_PD opiera się w dużej mierze na wcześniejszej strukturze JPK_KR (do której przesyłania zobowiązane były spółki dopiero na żądanie organu podatkowego) a jednocześnie ustawodawca nie wprowadził przepisów, które zobowiązywałyby zagraniczne oddziały prowadzące działalność poza Polską do prowadzenia ksiąg rachunkowych zgodnie z polską ustawą o rachunkowości.
Dotychczasowe Stanowisko Dyrektora KIS
W wydawanych dotychczas interpretacjach indywidualnych Dyrektor KIS jednoznacznie stał na stanowisku, że zagraniczny oddział nie jest odrębnym od jednostki macierzystej podmiotem, stanowi jedynie wyodrębnioną organizacyjnie i majątkowo część firmy, a spółka i oddział, poprzez który prowadzi ona działalność za granicą, są traktowane jako jeden podmiot.W związku z powyższym na polskiej spółce ciąży obowiązek prowadzenia ksiąg przy użyciu programów komputerowych oraz przesyłanie ich właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego po zakończeniu roku podatkowego, zgodnie z wprowadzoną strukturą dla JPK_CIT.Takie stanowisko zostało wyrażone m.in. w interpretacji indywidualnej Dyrektora KIS z dnia 6 lutego 2026 r., nr 0111-KDIB2-1.4010.585.2025.1.AJ.
W tym miejscu wskazujemy, że wydana pierwotnie interpretacja nie była nowym stanowiskiem Dyrektora KIS. Przy sporządzaniu wniosku o interpretację liczyliśmy się z ryzykiem uzyskania negatywnego stanowiska, tj. obowiązku prowadzenia przez oddziały zagraniczne ksiąg rachunkowych także w Polsce na podstawie ustawy o rachunkowości i ujmowania tych zapisów w JPK_CIT (tak Dyrektor KIS orzekał już we wcześniejszych interpretacjach, na przykład: int. ind. z dnia 14 marca 2025 r., nr 0111-KDIB1-2.4010.745.2024.1.AW; int. ind. z dnia 3 października 2025 r., nr 0111-KDWB.4010.100.2025.1.KKM) i koniecznością obronny odmiennego stanowiska przed sądami administracyjnymi.
Przy czym nasza kancelaria miała nadzieję, że organ podatkowy uwzględni, bądź odniesie się do powołanej we wniosku argumentacji Wnioskodawcy dotyczącej:
- braku przepisów zobowiązujących do prowadzenia ksiąg rachunkowych w Polsce dla wyodrębnionych jednostek organizacyjnych mających siedzibę w innych krajach, takich jak zagraniczne oddziały (przepisy przewidują obowiązek uwzględniania danych tych jednostek w łącznym sprawozdaniu finansowym, jednak nie przewidują jednoznacznego wymogu prowadzenia dla nich ksiąg w Polsce);
- zakresu przesyłanych danych – obejmujących zbiorcze dane samobilansujących zakładów, które są wymagane także dla skonsolidowanych sprawozdań finansowych i kalkulacji podstawy opodatkowania oraz podatku na podstawie ustawy o CIT, a nie kompletnych zapisów z ksiąg;
- braku dostosowania struktury JPK_CIT do uwzględnienia w niej danych z zagranicznych ksiąg prowadzonych przez oddziały samobilansujące;
- braku spójności z obecnym podejściem organów podatkowych, zgodnie z którym pliki JPK_KR i JPK_FA sporządzane na podstawie dotychczasowych przepisów (JPK_CIT ma zastąpić pliki JPK_KR), nie musiały uwzględniać zdarzeń dotyczących zagranicznych oddziałów (uwzględniając, że taki oddział rozlicza się podatkowo oraz wystawia faktury zgodnie z obcą jurysdykcją);
- uwarunkowań technicznych i nieproporcjonalności nałożonych obowiązków dotyczących zakresu danych, jakie miałyby być przesyłane w JPK_CIT, gdyby podatnicy mieli w nim uwzględniać również szczegółowe dane z ksiąg zagranicznych oddziałów prowadzonych w innych systemach finansowo-księgowych i zgodnie z inną jurysdykcją.
Zmiana z urzędu zaskarżonej interpretacji z dnia 15 kwietnia 2026 r., nr 0111-KDIB2-1.4010.585.2025.2.AJ
Zgodnie z nową interpretacją, Spółka nie jest zobowiązana do ujmowania w JPK_CIT szczegółowych danych zagranicznych oddziałów samobilansujących!
W uzasadnieniu wskazano, że księgi rachunkowe prowadzone dla potrzeb samobilansujących zagranicznych oddziałów nie podlegają przekazaniu w strukturze logicznej, o której mowa w art. 193a § 2 Ordynacji podatkowej. Dalej Dyrektor KIS potwierdził również, że Wnioskodawca nie będzie miał obowiązku uzupełnienia tych ksiąg o dodatkowe dane, o których mowa w Rozporządzeniu Ministra Finansów z 16 sierpnia 2024 r. w sprawie dodatkowych danych. Przy czym zastrzegł, że nieobjęcie ksiąg rachunkowych samobilansujących się oddziałów zagranicznych obowiązkami w zakresie JPK na gruncie ustawy o CIT nie zwalnia Spółki (macierzystej) z obowiązku wykazywania danych dotyczących tych oddziałów w prowadzonej przez nią ewidencji rachunkowej (np. pozabilansowej), jeżeli rzutują one na krajowe obowiązki podatkowe takiej jednostki, będącej de facto jednym bytem prawnym.
Możliwy wpływ interpretacji na przyszłe obowiązki
Otrzymana przez naszego Klienta zmiana stanowiska w powołanej interpretacji indywidualnej niewątpliwie jest przełomowa i korzystna dla Wnioskodawcy, jak również może przyczynić się do uproszczenia obowiązków dotyczących JPK_CIT także dla innych podatników, którzy posiadają zagraniczne oddziały samobilansujące. Przykładem zmiany kierunku dotychczas zajmowanego stanowiska jest również inna pozytywna interpretacja indywidualna z dnia 2 kwietnia 2026 r., nr 0111-KDIB1-2.4010.34.2026.2.EKB.
Zmiana jest o tyle istotna, gdyż w środowisku prawno-podatkowym spodziewano się również konsekwentnego prezentowania stanowiska przez Dyrektora KIS zakładającego szerokie ujmowanie danych zagranicznych w strukturze JPK_CIT i ewentualnej obrony stanowiska na etapie orzecznictwa sądów administracyjnych czy nawet przed NSA.
Potrzebują Państwo wsparcia?
Jeżeli chcą Państwo zabezpieczyć swoją spółkę w zakresie braku obowiązku złożenia JPK_CIT dla samobilansujących zagranicznych oddziałów Tax Support Center zapewnia pełne wsparcie przy przygotowywaniu i złożeniu interpretacji indywidualnej.
Autorzy:
Karolina Zieleniecka – Doradca podatkowy, Radca prawny, Menadżer podatkowy
Dominika Banasik – Konsultant podatkowy
Data publikacji: 24 kwietnia 2026 r.
